二、什麼是dna
DNA是一種長鏈聚合物，組成單位為四種脫氧核?酸，分別為：
腺嘌呤脫氧核?酸（dAMP ）、胸腺嘧啶脫氧核?酸（dTMP ）、胞嘧啶脫氧核?酸（dCMP ）、鳥嘌呤脫氧核?酸（dGMP ）。
而脫氧核糖（五碳糖）與磷酸分子藉由酯鍵相連，組成其長鏈骨架，排列在外側，四種鹼基排列在內側。每個糖分子都與四種鹼基裡的其中一種相連，這些鹼基沿著DNA長鏈排列而成的序列，可組成遺傳密碼，指導蛋白質的合成。讀取密碼的過程稱為轉錄，是以DNA雙股中的一條單股為模板轉錄出一段稱為mRNA（信使RNA）的核酸分子。多數RNA帶有合成蛋白質的訊息，有些本身就擁有特殊功能，例如rRNA、snRNA與siRNA。
在細胞內，DNA能與蛋白質結合形成染色體，整組染色體統稱為染色體組。對人類而言，正常的人體細胞含有46條染色體。染色體在細胞分裂前會先在分裂間期完成複製，細胞分裂間期可分割為：G1期-DNA合成前期、S期-DNA合成期、G2-DNA合成後期。對於真核生物，如動物、植物及真菌而言，染色體主要存在於細胞核內；而對於原核生物，如細菌而言，則主要存在於細胞質中的擬核內。染色體上的染色質蛋白，如組織蛋白，能夠將DNA進行組織並壓縮，以幫助DNA與其他蛋白質相互作用，進而調節基因的轉錄。
DNA是高分子聚合物，DNA溶液為高分子溶液，具有很高的黏度，可被甲基綠染成綠色。 DNA對紫外線（260nm）有吸收作用，利用此特性，可對DNA進行含量測定。當核酸變性時，吸光度升高，稱為增色效應；當變性核酸重新復性時，吸光度又會恢復到原來的水平。較高溫度、有機溶劑、酸鹼試劑、尿素、醯胺等都可能造成DNA分子變性，即DNA雙股鹼基間的氫鍵斷裂，雙螺旋結構解開—又稱DNA的解螺旋。
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單股DNA
單股DNA（single－stranded DNA）大部分DNA以雙螺旋結構存在，但一經熱或鹼處理就會變成單股狀態。單股DNA就是指以這種狀態存在的DNA。單股DNA在分子流體力學性質、吸收光譜、鹼基反應性質等方面都和雙股DNA不同。某些噬菌體粒子內含有單股環狀的DNA，這樣的噬菌體DNA在細胞內增殖時會形成雙股DNA。
閉環DNA
閉環DNA（closed circular DNA）沒有斷口的雙股環狀DNA，也稱為超螺旋DNA。由於具有螺旋結構的雙鏈各自閉合，結果使整個DNA分子進一步旋曲而形成三級結構。另外如果一條或二條鏈的不同部位上產生一個斷口，就會成為無旋曲的開環DNA分子。從細胞中提取出來的質粒或病毒DNA都含有閉環和開環這二種分子。可依兩者與色素結合能力的不同，而將兩者分離開來。
連接DNA
連接DNA （Linker DNA）：核小體中除147bp核心DNA 外的所有DNA。
模板DNA
模板DNA可以是單股分子，也可以是雙股分子，可以是線狀分子，也可以是環狀分子（線狀分子比環狀分子的擴增效果稍微好）。就模板DNA而言，影響PCR的主要因素是模板的數量和純度。
互補DNA
互補DNA（cDNA,complementary DNA）組成基因的雙股DNA分子以一條單股作為模板，轉錄產生與其序列互補的信使RNA分子，然後在逆轉錄?的作用下，以mRNA分子為模板，合成一條與mRNA序列互補的單股DNA，最後再以單股DNA為模板合成另一條與其互補的單股DNA，兩條互補的單股DNA分子組成一個雙股cDNA分子。因此，雙股cDNA分子的序列同轉錄所產生的mRNA分子的基因是相同的。所以一個cDNA分子就代表一個基因。但cDNA仍不同於基因，因為基因在轉錄產生mRNA時，有些不編碼的序列即內含子被刪除了，保留的只是編碼序列，即外顯子。所以cDNA序列都比基因序列短很多，因為cDNA中不包括基因的非編碼序列---內含子康藥本鋪
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四、什麼是垃圾DNA
垃圾DNA
一項針對基因組進行的廣泛比較研究顯示，問題的答案可能就隱藏在生物的垃圾脫氧核糖核酸（DNA）中。美國科學家發現，生物越複雜，其攜帶的垃圾DNA就越多，而恰恰是這些沒有編碼的「無用」DNA幫助高等生物進化出了複雜的機體。
自從第一個真核生物——包括從酵母到人類的有細胞核的生物——的基因組被破解以來，科學家一直想知道，為什麼生物的大多數DNA並沒有形成有用的基因。從突變保護到染色體的結構支撐，對於這種所謂的垃圾DNA的可能解釋有許多種。但是2004年從人類、小鼠和大鼠身上得到的完全一致的關於垃圾DNA的研究結果卻表明，在這一區域中可能包含有重要的調節機制，從而能夠控制基礎的生物化學反應和發育進程，這將有助於生物進化出更複雜的機體。與簡單的真核生物相比，複雜生物有更多的基因不會發生突變的事實無疑極大地強化了這一發現。
為了對這一問題有更深的了解，由美國加州大學聖塔克魯斯分校（UCSC）的計算生物學家David Haussler領導的研究小組，對5種脊椎動物——人類、小鼠、大鼠、雞和河豚——的垃圾DNA序列與4種昆蟲、兩種蠕蟲和7種酵母的垃圾DNA序列進行了比較。研究人員從對比結果中得到了一個驚人的模式：生物越複雜，垃圾DNA似乎就越重要。
這其中隱含的可能性在於，如果不同種類的生物具有相同的DNA，那麼這些DNA必定是用來解決一些關鍵性的液態威而鋼
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問題的。酵母與脊椎動物共享了一定數量的DNA，畢竟它們都需要製造蛋白質，但只有15%的共有DNA與基因無關。研究小組在2005年7月14日的《基因組研究》雜誌網絡版上報告說，他們將酵母與更複雜的蠕蟲進行了比較，後者是一種多細胞生物，發現有40%的共有DNA沒有被編碼。隨後，研究人員又將脊椎動物與昆蟲進行了對比，這些生物比蠕蟲更為複雜，結果發現，有超過66%的共有DNA包含有沒有編碼的DNA。
參與這項研究工作的UCSC計算生物學家Adam Siepel指出，有關蠕蟲的研究結果需要慎重對待，這是由於科學家僅對其中的兩個基因組進行了分析。儘管如此，Siepel還是認為，這項發現有力地支持了這樣一種理論，即脊椎動物和昆蟲的生物複雜性的增加主要是由於基因調節的精細模式。
